SMK Muhammadiyah 1 Bantul pada awal berdirinya bernama STM Muhammadiyah Bantul. STM MUHAMMADIYAH BANTUL didirikan atas prakarsa Bapak Mursidi yang kemudian membentuk panitia Pendirian STM Muhammadiyah Bantul. Pada bulan Nopember 1969 Panitia menghadap Pimpinan Muhammadiyah Daerah, dilanjutkan kepada Ketua Majelis Pendidikan Pengajaran dan Kebudayaan Daerah Kabupaten Bantul untuk mendapatkan persetujuan pendirian STM Muhammadiyah Bantul. Sehingga pada tanggal : 01 JANUARI 1970 berhasil mendapatkan piagam pendirian nomor : E-45/MPPM/SK/1970 dari Majelis pendidikan Pengajaran dan Kebudayaan, tentang persetujuan berdirinya STM Muhammadiyah Bantul dengan 2 jurusan :

1. Mesin Kontruksi
2. Bangunan Gedung

Berturut-turut kemudian memperoleh Piagam Pendirian dari Pimpinan Pusat Majelis Pendidikan Pengajaran dan Kebudayaan pada tanggal : 1 September 1977 dengan nomor : 2985/N.572/DIY.70/77. Kemudian memperoleh status terdaftar dari Kantor Wilayah Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Propinsi DIY pada tanggal : 24 Mei 1975, dengan nomor SK : C.396/Set.III.a/Kppt/75.

Dan memperoleh status : DIAKUI dengan piagam nomor : 001/C/KEP/I.86 tanggal 06 Januari 1986 dan disusul pula tahun berikutnya memperoleh Nomor Data Sekolah ( NDS ) yakni nomor : D.01.01 4301 berdasarkan Keputusan Direktur Jendral Pendidikan Dasar dan Menengah tgl : 23 Februari 1983 nomor : 018/C/Kep/I.83.

Pada perkembangannya STM Muhammadiyah Bantul kemudian menyesuaikan dengan regulasi pemerintah dan mengubah namanya menjadi SMK Muhammadiyah 1 Bantul yang hingga saat ini mempunyai 4 Program Keahlian yaitu :

1. Teknik Pemesinan
2. Teknik Kendaraan Ringan
3. Teknik Audio Video
4. Rekayasa Perangkat Lunak

Semua program keahlian tersebut telah melaksanakan akreditasi, yang terbaru pada bulan Nopember 2010 dengan nilai “A” di masing-masing program keahlian.

Seiring dengan perkembangan dunia pendidikan, sekolah dituntut untuk selalu meningkatkan pelayanan serta penataan sistem pengelolaan agar dapat memberikan pelayanan pendidikan yang berkualitas dan lebih baik, maka pada tahun 2011 SMK Muhammadiyah 1 Bantul mulai mengimplementasikan Penjaminan Mutu ISO 9001:2008 serta telah mendapatkan sertifikat dari PT TUV Reinland Indonesia Nomor : 824 100 12061

Sejak berdirinya hingga sekarang STM Muhammadiyah Bantul mengalami pergantian Kepala Sekolah sebagai berikut :

Data kepala sekolah dari awal sampai akhir :

• Tahun 1970 1972 dipimpin oleh Toekijar, BW.B.Sc .
• Tahun 1972 1977 dipimpin oleh Maryanto, B.Sc .
• Tahun 1978 – 1979 dipimpin oleh .Sumarlan, B.Sc….
• Tahun 1980 / 1981 dipimpin oleh Sumarlan, B.Sc…..
• Tahun 1981 / 1982 dipimpin oleh .Wasir Nuri, BA….
• Tahun 1982 / 1983 1985 / 1986 dipimpin oleh M. Basjir Dhl, BA
• Tahun 1986 / 1987 1987 / 1988 dipimpin oleh Rohadi, BA
• Tahun 1988 / 1989 1997 / 1998 dipimpin oleh Tukijar, B.Sc
• Tahun 1998 / 1999 – 1999 / 2000 dipimpin oleh H. Saebani Ymt
• Tahun 2000/2001 .. 2009/2010 dipimpin oleh Drs. Maryoto
• Tahun 2011 sampai sekarang… dipimpin oleh Widada S.Pd.